Beliau berkahwin dengan Dr. Florence Adams, MRCP (Eng.), LRCP (Lond.) Selepas kesatria James Thomson pada tahun 1959 beliau dikenali sebagai Toh Puan Datin Lady Florence Adams Thomson. Dia seorang doktor yang terlatih, bekerja di Rhodesia Utara di mana suaminya adalah Majistret Residen,[10][11] dan Pegawai Perubatan di Fiji.[12] Semasa mereka di Malaysia, beliau menjadi ketua pakar pemakanan di Institut Penyelidikan Perubatan di Kuala Lumpur, menjalankan penyelidikan dan pengarang beberapa artikel mengenai pemakanan kanak-kanak di Malaysia.[13] Apabila di Scotland, dan selepas bersara, mereka tinggal di Craig Gowan, Carrbridge, Badenoch dan Strathspey, rantau Highland (dahulu Inverness-shire)[5]